Les rongeurs commensaux sont à la fois des réservoirs de virus et des transmetteurs de maladies pour l'homme et certains animaux. La transmission s'effectue par l'intermédiaire de leurs déjections, de leurs morsures et des parasites qu'ils hébergent.
En 2015 une étude conduite par une équipe composée du CBGP, (UMR IRD-INRA-CIRAD-SupAgro Montpellier), de l’Institut Pasteur, de la Direction Générale de la Protection des Végétaux, de l’OMS (Gauthier et al., 2015) a permis d’identifier deux (2) nouveaux serovars de Leptospira kirschmeri sur des rongeurs du genre Arvicanthis et Cricetomys dans la ville de Niamey notamment au niveau des quartiers Lamordé et Yantala. Suite à ces travaux de recherche, le CERMES a jugé nécessaire de mener une exploration de la séroprévalence de Leptospirose chez l'homme, en ciblant ces quartiers riverains du fleuve où les maraîchers travaillent dans les jardins où les serovars ont été découverts (ex. Lamordé, jardins et habitations riveraines).