Le CILSS, dans le cadre du suivi de la situation alimentaire dans les pays membres, réalise chaque année une série de missions en collaboration avec ses partenaires et les gouvernements des pays concernés.
Il s’agit, généralement pour ces missions, d’étudier la situation et le déroulement de la campagne d’une part en rencontrant les services nationaux concernés par le suivi de la campagne agricole (Ministères de l’Agriculture et de l’Elevage, Météorologie Nationale, Protection des végétaux, Office céréalier, donateurs, etc.) et d’autre part en visitant certaines régions du pays pour se rendre compte de la situation sur le terrain.